我也很苦恼这个问题。目前可以替代的简单方法，一是直接用word插入脚注，把参考文献插在另一个word尾注，然后复制过来，无格式粘贴。
二是先用word插入脚注，再在脚注里插入引文。至于你说的点击word的脚注功能，然后使用endnote的插入选项，word文档中会自动在文字末尾生成一条相同的尾注条目，怎么破？这个你直接删掉尾注就可以了。
选中脚注，点段落，把那个“如果定义了文档网格，则对齐到网格”选中。
1、打开word文档，在文档中输入文字内容。
2、编辑完成后，插入脚注发现文档的中间有一大段空白，需要删除。
3、选中整个空白段落。
4、在键盘上按下“del”键，下方文字上衣，中间的空白段落删除即可。
把尾注改到文档结尾就好了，不要选择节的结尾
步骤一：编写好所有文档内容步骤二：将需要分栏的正文内容全部选中进行分栏步骤三：在word菜单栏选择：“工具—选项—兼容性”，在“兼容性”的“选项”栏里面找到“按word6.x/95/97的排放脚注”，并打勾然后确认。
步骤四：最后在你需要的地方插入脚注，此刻脚注内容不分栏显示了。注意：一定要先选定“按word6.x/95/97的排放脚注”，再插入脚注！在标题插入脚注，则脚注不分栏；在正文出插入脚注，则脚注分栏。
